Misato ve onun sinir karşıtı grubu Wille, artık çekirdekleşmeden kırmızı bir şehir haline gelen Paris’e varır. Amiral gemisi Wunder’ın mürettebatı bir muhafaza kulesine iner.
Evangelion 3.0+1.01 Thrice Upon A Time Filminin Konusu: Evangelion'un yeniden inşası serisinin son filmi olan Thrice Upon a Time'da, Willie'nin Paris'in eteklerine iniş yapmasıyla başlamaktadır ve macera dolu olaylar anlatılmaktadır.
